濟(jì)民可信:公司新冠中和抗體對(duì)奧密克戎兩大亞變體均有效
2022-04-20 17:49:43 來(lái)源:澎湃新聞
2021年11月以來(lái),奧密克戎(奧密克戎)變異株迅速取代以德?tīng)査―elta)為主的多種“令人擔(dān)心的變異株(VOC)”,成為主要流行變異株,給全球的疫情防控帶來(lái)巨大挑戰(zhàn)。
目前,奧密克戎主要有BA.1和BA.2兩個(gè)亞變體,世衛(wèi)組織報(bào)告曾指出, BA.2毒株更易傳播。4月19日,濟(jì)民可信官方發(fā)布消息稱,為揭示奧密克戎BA.2變異株傳染性增強(qiáng)的原因,尋找預(yù)防及治療的更有效手段,中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所徐華強(qiáng)/尹萬(wàn)超團(tuán)隊(duì)聯(lián)合濟(jì)民可信研究團(tuán)隊(duì)聚焦奧密克戎變異株刺突蛋白,開(kāi)展系統(tǒng)的功能測(cè)定和機(jī)制研究。
研究發(fā)現(xiàn),奧密克戎BA.2比BA.1結(jié)合受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)的能力增強(qiáng)2倍左右。同時(shí),研究還指出,新冠中和抗體JMB2002對(duì)奧密克戎BA.2、BA.1變異株均有中和能力。該研究論文近期已在線刊登于預(yù)印本bioRxiv網(wǎng)站。
新研究揭示奧密克戎BA.2傳染性更強(qiáng)的原因結(jié)合力檢測(cè)顯示,奧密克戎BA.2相比BA.1變異株刺突蛋白,結(jié)合受體ACE2的能力增強(qiáng)2倍左右;同時(shí),熱力學(xué)實(shí)驗(yàn)顯示,BA.2相比BA.1變異株刺突蛋白,擁有更穩(wěn)定的受體結(jié)合功能域(RBD),以及更為靈活的變異株刺突蛋白三聚體;從解析的BA.2刺突蛋白結(jié)合其受體ACE2的結(jié)構(gòu)中,同樣看到刺突蛋白三聚體內(nèi)相鄰RBD特異的相互作用,形成類似BA.1變異株刺突蛋白結(jié)構(gòu)中的RBD二聚體(圖1B-1C)。
另外,從解析的BA.2刺突蛋白結(jié)合其受體ACE2的結(jié)構(gòu),可以看到BA.2相比BA.1變異株刺突蛋白,更傾向于處于RBD打開(kāi)的可以結(jié)合受體ACE2的構(gòu)象,這些信息都解釋了奧密克戎變異株BA.2比BA.1傳染性增強(qiáng)的問(wèn)題。
圖1 ?A,2022年以來(lái)三種突變株新冠病毒感染占比變化圖;B,奧密克戎 BA.2 相對(duì)原始型的突變位點(diǎn)展示;C,奧密克戎 BA.2突變株刺突蛋白三聚體結(jié)合受體3個(gè)ACE2的結(jié)構(gòu)側(cè)面展示;D,奧密克戎 BA.2突變株刺突蛋白三聚體結(jié)合抗體JMB2002的結(jié)構(gòu)頂面展示;E,抗體JMB2002阻礙人ACE2蛋白結(jié)合突刺蛋白圖示
綜合BA.2和BA.1變異株刺突蛋白分別結(jié)合受體人源ACE2的結(jié)構(gòu),研究發(fā)現(xiàn),刺突蛋白上只有不到10%的突變位于蛋白內(nèi)部,其它突變都位于刺突蛋白表面(圖1B),包括多類中和抗體結(jié)合的抗原表位。這從結(jié)構(gòu)上解釋了奧密克戎變異株BA.2和BA.1都可以抵抗大部分中和抗體的分子機(jī)制。
從突變數(shù)量看,BA.2與BA.1變異株刺突蛋白分別擁有31和37處點(diǎn)突變,而B(niǎo)A.2與BA.1變異株刺突蛋白相比,也有22處點(diǎn)突變差異。從刺突蛋白1273個(gè)氨基酸序列的整體看,奧密克戎變異株的突變率都在3%以內(nèi),刺突蛋白表面的大部分仍與原始株接近,因此以原始株為基礎(chǔ)研發(fā)的初代疫苗和部分中和抗體,仍可以在一定程度上保護(hù)奧密克戎感染者。這從結(jié)構(gòu)上了解釋了初代疫苗引起的抗奧密克戎變異株的免疫保護(hù)機(jī)制,同時(shí)也為提倡盡快盡早進(jìn)行第三針新冠疫苗全員接種提供了理論依據(jù)。
濟(jì)民可信中和抗體JMB2002具有廣譜抗新冠病毒的潛力?本項(xiàng)研究還顯示,濟(jì)民可信鄧俗俊團(tuán)隊(duì)自主開(kāi)發(fā)的新型作用機(jī)制的中和抗體JMB2002,可以高親和力結(jié)合BA.2變異株刺突蛋白,并抑制BA.2變異株病毒進(jìn)入細(xì)胞復(fù)制,且抑制活性與BA.1變異毒株相當(dāng)。
2022年2月,以“Structures of the 奧密克戎 Spike trimer with ACE2 and an anti-奧密克戎 antibody”為題在線發(fā)表于《Science》雜志的一篇研究論文顯示,新冠中和抗體JMB2002具有廣譜抗新冠病毒的分子機(jī)制。
在上述研究成果基礎(chǔ)上,研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步攻克了BA.2變異株刺突蛋白與特異性治療抗體JMB2002的結(jié)構(gòu)(圖1D)。通過(guò)結(jié)構(gòu)比較,可以看到,JMB2002結(jié)合BA.2與BA.1變異株刺突蛋白相同的抗原表位,也是通過(guò)阻礙刺突蛋白結(jié)合其受體ACE2實(shí)現(xiàn)對(duì)BA.2變異株的抑制(圖1E)。
濟(jì)民可信稱,這些數(shù)據(jù)進(jìn)一步佐證了JMB2002抗體具有廣譜抗新冠病毒的巨大潛力。
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